A kép forrása: Dívány
A tó ökoszisztémájára is hatással van a kártevők jelenléte. A Balatonon szélmalomharcot folytatnak ellenük.
Fonyód környékén kárókatonák nagy számban jelentek meg, melyet Szári Zsolt, a Balatoni Halgazdálkodási Zrt. vezetője hívott fel a figyelemre. A kormoránok tömegesen fogyasztják a halakat, veszélyeztetve ezzel a Balaton állományát. A madarak elleni védekezés nehézségeivel küzdenek, mivel korlátozott a kilövés lehetősége. A Balatoni Halgazdálkodási Zrt. 2000 madár kilövésére van engedélye a halastavaiban. Szári Zsolt szerint a Balaton befagyása segíthetne a madarak jelenlétének csökkentésében, azonban az elmúlt években ez nem következett be, tovább súlyosbítva a problémát.